Экологические проблемы сегодняшнего мира становятся проблемами «жизни или смерти». Игнорирование этих проблем могут довести многие страны до гибели без всяких войн – если нормой «жизни» станут ядовитые выбросы в водоёмы и атмосферу, повышенная радиация и т.д. Противодействовать этому может лишь научный подход, повышения уровня знаний населения в вопросах экологической безопасности. Главные аспекты деятельности «САН» в данном направлении:

 – Разработка программ экологического народного контроля над каждым экологически опасным объектом в каждом регионе, городе, селе;

– Содействие созданию курсов массового обучения людей экологической безопасности, контролю над выбросами вредных веществ, умение их фиксировать, зная допустимые законом нормы.

Объединяет секторы:

1.Общественного экологического контроля и экологической безопасности. 

2.Разработки и содействия реализации различных экологических проектов и программ улучшения экологического состояния конкретных регионов. 3.Содействие экологическому обучению и воспитанию населения.

Возглавляет департамент академик О.К.Аветисов – профессиональный эколог-практик с многолетним опытом. Существенную помощь в деятельности департамента оказывает академик САН, доктор биологических наук, профессор Ю.Ф.Мишанин. Одним из главных загрязнителей экосреды Севастополя является автотранспорт, количество которого многократно увеличилось в городе, особенно в последние годы. «Севастопольская Академия Наук» предлагает ряд конструктивных мер для оздоровления сложившейся ситуации, в частности создана «Программа развития автотранспортного комплекса Крыма и Севастополя» (автор академик В.Цыбулькин), где предлагаются конкретные меры по сбалансированию автотранспортной системы города, постепенному переходу на газомоторный и электротраспорт и т.д.